B1 · Episode 29 · 4:46
Maxime, lecturer-researcher (2): Motivation for interdisciplinary research
He explains his motivation to apply computer science methods—such as graph theory—to biological problems, highlighting the appeal and challenges of bioinformatics and interdisciplinary collaboration.
Source：Qu'est-ce que Tu GEEKes ? · License：CC BY-SA 4.0
Transcript
Ce qui m'a attiré vers ce sujet à la base, parce que moi je fais plutôt une
What initially attracted me to this subject, because I am trained as a
formation d'informaticien, c'est de
computer scientist, is to
pouvoir appliquer mes notions d'informatique
apply my computer science knowledge
à des problèmes plus concrets et en dehors de l'informatique plus traditionnelle.
to more concrete problems and problems beyond traditional computer science.
Donc pour ça, la bioinformatique est plutôt intéressante, c'est justement
Therefore, bioinformatics is quite interesting—it is precisely
l'application des méthodes informatiques à des problèmes biologiques.
the application of computational methods to biological problems.
Donc on va prendre des problèmes purement informatiques, tout ce qui est graphe,
So we take purely computational problems—everything related to graphs,
parcours de graphe, recherche de propriétés dessus,
graph traversal, searching for properties on graphs,
et on se dit que peut- être que si on applique ça à des problèmes biologiques,
and ask ourselves: what if we apply these to biological problems represented using these computational tools?
représentés sous la forme de ces outils informatiques, on va pouvoir faire
we might advance another field and see concrete applications.
progresser un autre domaine et voir des applications concrètes.
we might advance another field and see concrete applications.
Alors en pratique, les applications concrètes, elles sont quand même très loin,
In practice, however, these concrete applications are still quite distant,
parce que même si on trouve un modèle intéressant et un résultat intéressant sur ce
because even if we find an interesting model and an interesting result on this
modèle, il faut encore vérifier ça expérimentalement derrière,
model, it still needs experimental validation afterward,
et bon, ça prend beaucoup de temps.
and well, that takes a lot of time.
Malgré ça, je trouve que c'est intéressant quand même de s'extraire de ce domaine
Despite this, I find it interesting nonetheless to step outside this field,
purement de l'informatique et d'aller voir un autre domaine,
purely computer science and look into another field,
même si ce qui est frustrant à l'inverse, c'est que les biologistes ont une vision
and conversely, what’s frustrating is that biologists have a very different view of information in general,
très différente de l'information en général.
a very different view of information in general.
Et on va dire qu'il n'y a pas une règle sans qu'il y ait dix exceptions derrière,
And we could say there’s no rule without ten exceptions behind it,
alors qu'en informatique, on essaie au contraire de faire en sorte que tout soit
whereas in computer science, we instead try to make everything
très carré. Donc ça c'est une motivation, une autre motivation c'est aussi le
very well-defined. So that’s one motivation; another motivation is also
fait de découvrir des choses.
the act of discovering things.
En fait, c'est vrai que quand on commence la
In fact, it’s true that when one begins
recherche, on s'en rend pas toujours compte, mais
research, one doesn’t always realize it, but
le terrain des choses à explorer est absolument énorme.
the terrain of things to explore is absolutely enormous.
Et la recherche c'est en fait une toile qu'on essaie de tisser avec des collègues
And research is actually a web we try to weave together with colleagues
qui permet d'avancer au fur et à mesure.
that enables progress step by step.
Donc des fois on tisse plutôt dans son coin, des fois on fait des ponts avec
So sometimes we weave more on our own, sometimes we build bridges with
d'autres gens, et tout ça c'est super motivant en fait justement de réussir à relier
other people, and all of this is truly motivating—especially succeeding in connecting
le morceau qu'on a commencé à tisser de progrès dans la science qu'on a fait
the piece we began weaving of progress in science we've made.
avec d'autres gens qui sont autour et avec qui on interagit.
with other people who are around and with whom we interact.
Après, ce qui me motive encore, c'est justement les interactions avec les autres
Afterwards, what still motivates me is precisely interactions with others.
personnes, parce que c'est toujours très enrichissant, et aussi parfois avec les
people, because it's always very enriching, and also sometimes with the.
étudiants, parce qu'on en croise
students, because we often encounter.
souvent, que ce soit dans les activités d'enseignement ou d'encadrement de projets
them, whether in teaching activities or project supervision.
ou de thèse, et bien tout ça c'est très intéressant, très enrichissant.
or thesis supervision, and all this is very interesting, very enriching.
Ok. C'est vrai que la recherche, c'est pas forcément un truc très connu dans le
Ok. It's true that research isn't necessarily something very well known to the.
manière de fonctionner par le grand public,
general public's way of functioning.
et c'est vrai que c'est quelque chose de super intéressant.
and it's true that it's something super interesting.
Nouvelle question du coup, est- ce que tu peux nous dire comment t'es arrivé jusque
New question then: can you tell us how you arrived here, in fact what's your path.
là, en fait quel est ton parcours qui t'a amené jusqu'au métier de chercheur?
that led you to the profession of researcher?
Oui, alors mon parcours, c'est qu'après le lycée, j'ai fait deux ans de classes
Yes, so my path is that after high school, I did two years of preparatory classes.
préparatoires pour ensuite intégrer l'École centrale de Nantes.
to then enter École centrale de Nantes.
Où en fait, pendant le cursus, je
Where, in fact, during the curriculum, I.
trouvais que le diplôme d'ingénieur, c'était intéressant, mais pas très orienté vers
found the engineering degree interesting, but not very oriented toward
moi ce que j'aimais, c'est- à- dire les sciences fondamentales.
what I loved, namely fundamental sciences.
Et donc en parallèle, j'ai fait aussi un master recherche.
And so in parallel, I also completed a research master's degree.
En même temps que ma dernière année d'école d'ingénieur, ce qui m'a permis de
during my final year of engineering school, which enabled me to
rentrer en thèse de doctorat après, toujours à l'École centrale de Nantes,
enter a doctoral thesis program afterward, still at École centrale de Nantes,
et donc j'ai fait ma thèse là bas dans un laboratoire qui s'appelait à l'époque l'IR
and thus I carried out my thesis there in a laboratory then called IR
锡 n et qui s'appelle aujourd'hui le LS2N, le Laboratoire des Sciences du Numérique
n, and now named LS2N, the Laboratory of Digital Sciences
de Nantes. Et encadré par Morgane Magnien et Aude Yerrou.
of Nantes. Supervised by Morgane Magnien and Aude Yerrou.
Et donc pendant ces trois ans de thèse, toujours à l'École centrale de Nantes,
And so during these three years of doctoral research, still at École centrale de Nantes,
j'ai commencé mes sujets sur l'analyse de modèles.
I began working on topics related to model analysis.
Mais en fait, une fois ma thèse terminée, cette fois on est arrivé en 2014,
But in fact, once my thesis was completed, this time we had reached 2014,
il ne faut pas s'imaginer que tout de suite on va avoir un poste de chercheur ou de
one must not imagine that one immediately obtains a researcher or lecturer position somewhere.
maître de conférences quelque part.
lecturer somewhere.
Malheureusement, en fait, il faut encore enchaîner
Unfortunately, in fact, one must still undertake
ce qu'on appelle des CDD de recherche ou des post- doc.
what are called fixed-term research contracts or post-doctoral positions.
ou bref des petits contrats courts,
or briefly, short-term small contracts,
courts à l'échelle du
short in the context of the profession,
métier, qui durent généralement un an, parfois deux ou trois,
typically lasting one year, sometimes two or three,
et qui permettent en fait de continuer à faire de la recherche en attendant de
and which in fact allow continuing research while waiting to
pouvoir participer à des concours pour être recruté définitivement dans une
be able to take competitive exams for permanent recruitment into an institution.
institution. Donc là, j'ai fait cinq années de postdoc.
So there, I did five years of postdoc.
J'ai fait une année à
I spent one year at
l'Université de Kassel en Allemagne.
the University of Kassel in Germany.
Ensuite, j'ai fait une année à l'Université de Nice Sophia Antipolis.
Then, I spent one year at the University of Nice Sophia Antipolis.
Là où j'ai rencontré Émilien d'ailleurs.
There, I met Émilien, by the way.
J'ai fait une année de retour à Nantes, cette
I spent a year back in Nantes, this
fois plutôt côté université de Nantes, mais toujours dans le même laboratoire où
this time mainly at the University of Nantes, but still in the same laboratory where
j'ai pu encore collaborer avec le directeur de thèse.
I could still collaborate with my thesis supervisor.
Ensuite une année à l'université de Rennes et
Then one year at the University of Rennes and
enfin encore une année à Nantes, mais cette fois sous l'égide du CNRS,
finally another year in Nantes, but this time under the auspices of the CNRS.
donc le Centre National de la Recherche Scientifique, mais hébergé à Nantes toujours
so the French National Centre for Scientific Research, but hosted in Nantes still.
dans le même laboratoire et encore avec d'autres équipes, ce qui m'a permis de
in the same laboratory and still with other teams, which enabled me to
rencontrer encore d'autres gens.
meet even more people.
Et aujourd'hui, je suis recruté à
And today, I am recruited at
l'École centrale de Lille depuis 2019.
École Centrale de Lille since 2019.
Et donc entre 2011 où j'ai démarré ma thèse, où j'ai vraiment commencé la recherche,
And so between 2011, when I started my thesis, when I truly began research,
et 2019, il s'est passé un certain temps.
and 2019, some time has passed.
Et voilà mon parcours.
And there you have my career path.
D'accord, effectivement, c'est un parcours long, mais c'est le cas pour tout le
Okay, indeed, it’s a long path, but that’s the case for everyone.
monde. Et encore en informatique, des fois c'est un peu plus rapide que
And still in computer science, sometimes it’s a bit faster than
dans d'autres domaines comme la biologie.
in other fields like biology.